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反转录转座子

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反转录转座子(retrotransposon或retroposon)指通过核糖核酸为中介,反转录成脱氧核糖核酸后进行转座的可动元件。这样的转座过程称为反转座作用(retrotransposition)。它们是许多真核生物中数量最大的一类可活动遗传成分,在植物中特别丰富,是核DNA的一个主要组成部分。例如,在玉米的基因组中,49-78%是反转录转座子,而在小麦中包含约90%的基因组重复序列和68%的转座子。在哺乳纲中,几乎有一半的基因组(45%至48%)包含转座子或残余转座子。人类基因组有大约42%反转录转座子,而脱氧核糖核酸转座子约占2-3%。

内容简介

反转座作用出现在真核生物,包括能自由地感染宿主细胞反转录病毒,以及通过以核糖核酸为中介进行转座的DNA序列。除反转录病毒外,反转录转座子可以分成两类:一类是病毒超家族(viral 总科),这类反转录转座子编码反转录酶或整合酶(integrases),能自主地进行转录,其转座的机制同反转录病毒相似,但不能像反转录病毒那样以独立感染的方式进行传播;另一类是非病毒超家族(nonviral superfamily),自身没有转座酶或整合酶的编码能力,而在细胞内已有的酶系统作用下进行转座。病毒超家族同非病毒超家族都来源于细胞内的转录物,两者的明显区别在于病毒超家族成员的脱氧核糖核酸分子两端有长末端重复序列(long terminal repeats,LTR),这是反转录病毒DNA基因组的特征性结构,非病毒超家族的成员没有LTR结构。同时,病毒超家族成员都能编码产生转座酶或整合酶,或者二者兼而有之,所以能自主地进行转座。非病毒超家族成员不产生有生物学活性的酶,因此不能进行自主转座。但所有反转录转座子都有一个共同的特点,即在其插入位点上产生短的正向重复序列

反转录转座子的两大类

反转录转座子可以分成两大类:

一类是LTR反转录转座子,包括Tyl-copia类和Ty3-gypsy类转座子,是具有长末端重复序列(long terminal repeats,LTR)的转座子。这类反转录转座子可以编码反转录酶(Reverse transcriptases)或整合酶(integrases),自主地进行转录,其转座机制同反转录病毒相似,但不能像反转录病毒那样以自由感染的方式进行传播。维管植物中的反转录转座子主要属于Tyl-copia类,分布十分广泛,几乎覆盖了所有高等植物种类。

另一类是非LTR反转录转座子,包括LINE(long interspersed nuclear elements,长散布核元件)类、SINE(Short interspersed nuclear elements,短散布核元件)类、复合SINE转座子类,没有长末端重复序列(non-long terminal repeats,non-LTR),自身也没有转座酶或整合酶的编码能力,需要在细胞内已有的酶系统作用下进行转座。

参考资料